Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd5G3UW60 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd5G3UW60 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms