Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34aG3UW52 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34aG3UW52 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms