Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ScaperF8VQ70 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ScaperF8VQ70 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms