Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Colca2F8VPY8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colca2F8VPY8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms