Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcdh9F8VPK8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdh9F8VPK8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdh9F8VPK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcdh9F8VPK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms