Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-M1F7CXU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M1F7CXU4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms