Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm28038F7BCN9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm28038F7BCN9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms