Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp988F6VKC7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp988F6VKC7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms