Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plekhg1F6S200 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plekhg1F6S200 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms