Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmod3E9QA62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmod3E9QA62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms