Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cald1E9QA15 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cald1E9QA15 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms