Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh18E9Q9Q6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh18E9Q9Q6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms