Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms