Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aknad1E9Q8N6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aknad1E9Q8N6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms