Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp31E9Q6Y8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp31E9Q6Y8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp31E9Q6Y8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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