Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Simc1E9Q6E9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Simc1E9Q6E9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms