Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85cE9Q6B2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms