Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BC005561E9Q5E2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms