Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NbasE9Q411 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NbasE9Q411 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms