Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd1E9Q3H4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd1E9Q3H4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms