Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pdzd2E9Q1M1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzd2E9Q1M1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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