Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Zfp558E9Q1J0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms