Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdr1E9Q0B4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdr1E9Q0B4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms