Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3095E9Q058 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3095E9Q058 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms