Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc1E9PZP8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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