Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pkhd1E9PZ36 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkhd1E9PZ36 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms