Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ13

Gm10608, Predicted gene 10608, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10608E9PZ13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10608E9PZ13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm10608E9PZ13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms