Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsph10bE9PYQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms