Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4931408C20RikE9PWP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931408C20RikE9PWP9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms