Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim30dE9PWL0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30dE9PWL0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms