Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abca16E9PWJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abca16E9PWJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abca16E9PWJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 802.9 ms