Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc144bE9PVZ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms