Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ttc17E9PVB5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc17E9PVB5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms