Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Soga1E1U8D0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Soga1E1U8D0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms