Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl3E0CZ16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms