Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5478D3Z6R0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5478D3Z6R0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5478D3Z6R0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5478D3Z6R0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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