Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn2r49D3Z6L3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms