Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930407I10RikD3Z5T8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
4930407I10RikD3Z5T8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930407I10RikD3Z5T8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms