Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
5430403G16RikD3Z5L4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
5430403G16RikD3Z5L4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms