Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm1330D3Z460 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm1330D3Z460 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms