Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm3543D3Z235 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3543D3Z235 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3543D3Z235 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3543D3Z235 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3543D3Z235 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3543D3Z235 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3543D3Z235 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3543D3Z235 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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