Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms