Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc8D3YZV8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc8D3YZV8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms