Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc6D3YZP9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc6D3YZP9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms