Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samd1D3YXK1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samd1D3YXK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samd1D3YXK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms