Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc13D3YV10 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc13D3YV10 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms