Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
1700015F17RikD3YUK8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700015F17RikD3YUK8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
1700015F17RikD3YUK8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms