Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kpna7C0LLJ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kpna7C0LLJ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms