Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r180B9EK86 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r180B9EK86 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms