Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20547B8JJN0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20547B8JJN0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms